1）牦牛肝片吸虫病
肝片吸虫病又称肝蛭病，由吸虫纲片形科肝片吸虫寄生在肝脏胆管内，引起急性或慢性肝炎或胆囊炎，伴发全身性中毒和营养障碍，造成大批死亡。
牦牛肝片吸虫病，分布普遍，感染率为20%-50%。
牧民们知道沼泽低湿地带放牧牛、羊，容易感染肝片吸虫病。因此他们对利用沼泽地有丰富的经验，春季一般是半天利用沼泽地、半天利用干燥地放牧，暴雨后不利用沼泽地；每年冬季轮换烧沼泽地，以消灭肝片吸虫的中间宿主——锥实螺。
2）牦牛棘球蚴病
棘球蚴病是由某些绦虫的中绦期囊体——棘球蚴寄生于人和哺乳动物的脏器引起的一种人畜共患的寄生虫病，对人畜的危害都严重。在我国牧区分布广泛。在四川阿坝州牧区解剖的牦牛、犏牛，几乎每头都有棘球蚴感染，感染程度从数个至十余个不等。
3）牦牛的肺丝虫病
牦牛的肺丝虫病主要由圆形亚目网尾科网尾属的胎生网尾线虫寄生的气管和支气管引起，主要危害犊牦牛。
朱辉清等用国产广谱驱虫药丙硫苯眯唑对牦牛、绵羊寄生蠕虫进行驱虫试验，按30mg/kg体重的剂量，1次口服，对牦牛胎生网尾线虫幼虫和成虫的减少率均为，无毒副作用。
4）牦牛胃肠道线虫病
牦牛胃肠道线虫病，在我国牦牛分布地区广泛存在，且多为混合性感染，是牦牛群中严重的寄生虫病之一。
陈德明等用国产5%磷酸左旋眯唑注射液，按2mg/kg、4mg/kS、6mg/kg体重的剂量皮下注射，对牦牛捻转血矛线虫、仰口线虫、结节虫、毛首线虫的驱虫率为：朱辉清等用国产广谱驱虫药丙硫苯咪唑按30mg/kg体重的剂量1次口服，对牦牛仰口线虫、普通奥斯特线虫、结节虫、毛首线虫、夏伯特线虫等的驱虫率和虫卵减少率均为。
5）牦牛脑包虫病
脑包虫病又称多头蚴病。是由于寄生于犬肠道内的多头绦虫的幼虫寄生在牛、羊脑内而引起的寄生虫病，民间称“转圈病”。它是以犬、狼、狐等作为中间宿主，当牦牛吃了被随粪便排到体外的虫卵污染的牧草或饮水后，虫卵的卵膜在肠道内被溶解，六钩蚴脱出，并钻入肠黏膜的毛细血管内，随血液循环到达脑部和脊髓，以脑部寄生为多。
生前诊断主要依靠患牛有无转圈等强直运动以及有无痉挛表现，但诊断不太容易。防治办法主要为消灭狼和野狗，对牧犬每年进行2-4次定期驱虫，驱虫办法：每公斤活重用氢溴酸槟榔素0.002g-0.003g，包于肉中喂食。驱虫时将犬拴住，先饥饿16-18h后服药。驱虫后的粪便收集掩埋处理。
6）牛囊虫病
牛囊虫病又称牛囊尾蚴病。是由人的牛肉绦虫的幼虫——牛囊尾蚴侵袭牛体的各部肌肉组织和器官的一种寄生虫病。一般病牛不显任何临床症状，仅极少数病牛因囊尾蚴侵害心脏时，则发生心力衰竭等症状。生前一般难以诊断，主要依靠屠宰后检查咬肌、舌肌、深腰肌和膈肌，以发现囊尾蚴而确诊。在本病流行地区，对所有的人员都要进行粪便虫卵检查，并对患牛肉绦虫的患者定期驱虫。
本病目前尚无治疗方法。
7）牦牛牛皮蝇蛆病
牛皮蝇蛆病是危害较严重的一种蝇蛆病。在牦牛、犏牛中流行极为普遍，青海、甘肃个别地区曾发现有人感染牛皮蝇幼虫，并引起严重病症的报道。
结果证明，以倍硫磷原液按每l00kg体重0.5ml-0.6ml剂量肌肉注射和倍硫磷微型胶囊按每l00kg体重7mg-9mg皮下包埋的效果为好，杀虫率均为。
8）牦牛的外寄生虫病
牦牛的外寄生虫，主要有腭虱、毛虱、蠕形蚤、蜱等。主要寄生在体表被毛稀少的部位，如胸背部、肩胛部、臀部等。
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